آموزش شبیه سازی دینامیک مولکولی آب+متانول و آب+نرمال هگزان

تصویر شاخص

دینامیک مولکولی در حقیقت یک آزمایشگاه کامپیوتری می‌باشد که می‌توان از آن برای پیش‌بینی نتایج در شرایط سخت دما، فشار و … استفاده کرد. مراحل مختلف دینامیک مولکولی اهمیت خاص خود را دارد و در این درس‌نامه سعی شده است که مراحل شبیه‌سازی دینامیک مولکولی در نرم‌افزار material studio برای یک سامانه آب+متانول و آب+نرمال هگزان توضیح داده شود. مباحثی که در این درس‌نامه آورده شده است عبارت است از:

  • مراحل چهارگانه در شبیه‌سازی دینامیک مولکولی شامل فاز آغاز (initialization)، فاز تعادل (equilibrium)، فاز تولید (production) و آنالیز (Analysis)
  • توانایی‌های مختلف و متنوع نرم‌افزار
  • نحوه ترسیم ساختار مولکولی در نرم‌افزار material studio و تنظیمات مختلف مربوط به شماتیک مولکول در قسمت Display style
  • نحوه اندازه‌گیری فاصله پیوند، زاویه پیوند و زاویه دو وجهی (مثلاً در مولکول متانول)
  • معرفی ابزار forcite در نرم‌افزار برای محاسبات دینامیک مولکولی
  • نحوه بهینه‌سازی ساختار هندسی مولکولی جهت به دست آوردن ساختار پایدار و بهینه مولکول
  • ساخت جعبه (cell) از مولکول­های بهینه‌شده توسط ابزار amorphous calculation و amorphous construction
  • نحوه ساخت انواع سل‌های مکعب مربع (cubic)، اورتورومبیک (orthorhombic) و تتراگونال (tetragonal)
  • نحوه محاسبه طول سل
  • اهمیت دانسیته اولیه در ساخت سل
  • بهینه‌سازی سل ساخته شده و تنظیم پارامترهای مربوط به آن
  • نحوه اعمال هنگرد (ensemble) پیش NVT (مرحله تعادل)، اهمیت سرعت اولیه و ترموستات دمایی (velocity scale)، ارتباط بین دما و سرعت، الگوریتم تعادل دمایی، مقادیر انرژی کل، انرژی جنبشی، انرژی پتانسیل، انرژی بین مولکولی و انرژی درون مولکولی، نحوه نمونه بردای از ساختارهای شبیه‌سازی شده (frame)، نمایش فریم ها جهت مشاهده حرکات مولکول‌ها و مسیر آن‌ها
  • نحوه اعمال هنگرد NVT اصلی (مرحله تعادل)، ترموستات برندسن (Brendsen)
  • نحوه اعمال هنگرد NPT جهت تنظیم دما و فشار سامانه، الگوریتم تنظیم فشار، بارواستات آندرسون (Andeson)، مشاهده تغییر دانسیته، ابعاد سل
  • نحوه اعمال NVT نهایی (مرحله تولید)، ترموستات نوز-هاور (NHL)
  • نحوه متوقف کردن شبیه‌سازی در صورت اشتباه بودن تنظیمات
  • نحوه آنالیز کردن نتایج حاصل از شبیه‌سازی
  • تعریف و نحوه محاسبه تابع توزیع شعاعی (radial distribution function)
  • نحوه تعریف set برای آنالیز، نحوه ترسیم تابع توزیع شعاعی، کپی کردن داده درون متلب (MATLAB)، نحوه ترسیم دانسیته محلی
  • نحوه ترسیم پروفایل غلظت، نحوه ترسیم میانگین مربعات جابجایی و محاسبه ضریب نفوذ از آن، نحوه ترسیم پروفایل سرعت

 

۵ دقیقه اول

۵ دقیقه دوم

۵ دقیقه سوم

۵ دقیقه چهارم

۵ دقیقه پنجم

جلسه اول

جلسه دوم

قسمت سوم

قسمت چهارم

قسمت پنجم

لایسنس

دیدگاهتان را با ما درمیان بگذارید
تعداد دیدگاه : 0
امتیاز کلی : 0.0
پیشنهاد شده توسط : 0 کاربر
بر اساس 0 فروش
0
0
0
0
0

هیچ دیدگاهی برای این محصول نوشته نشده است.

 

 

 

 

 

 
اولین کسی باشید که دیدگاهی می نویسد “آموزش شبیه سازی دینامیک مولکولی آب+متانول و آب+نرمال هگزان”

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد.

قیمت محصول

150,000 تومان

تعداد
امتیازی ثبت نشده است
تعداد دانشجو : 4
مدت دوره: 02:38ساعتتاریخ انتشار: 31 مارس 2023آخرین بروزرسانی: 8 فوریه 2024تعداد بازدید: 826
قوانین استفاده

           

مدرس

دکتر جابر یوسفی سیف

این فیلم آموزشی توسط دکتر جابر یوسفی سیف تهیه شده است.
قیمت محصول

150,000 تومان

تعداد